Les différentes compositions d'endotoxines peuvent conduire à trois formes de phénotype bactérien, à savoir le type lisse, le type rugueux et le type intermédiaire (également appelé type muqueux). Lorsque le composant polysaccharidique central est réduit ou endommagé, l'apparence des colonies de culture bactérienne est rugueuse, on l'appelle donc mutant rugueux (rugueux-LPS, R), qui peut être appelé Rb-LPS, Rc-LPS, Rd-LPS, Re -LPS en fonction du degré de défaut du polysaccharide central, comme indiqué sur la figure .
Le microscope électronique d'Escherichia coli LPS avec des colonies lisses est une structure en forme de cordon mince, tandis que le type rugueux d'Escherichia coli LPS est principalement une structure circulaire. En raison des différentes longueurs de sa chaîne de sucre, différents effets d'encombrement stérique seront produits, ce qui affectera la reconnaissance et la phagocytose du LPS et du CNB par les cellules immunitaires du corps, de sorte que l'hôte aura différents effets immunitaires sur lui et affectera le élimination des bactéries par l'organisme.
La chaîne de sucre de type rugueux est courte et facile à avaler par les phagocytes, tels que les phagocytes professionnels : les neutrophiles et les macrophages, qui sont faciles à éliminer les bactéries de type rugueux ; La chaîne de sucre lisse est longue, a un encombrement stérique, n'est pas facile à avaler par les phagocytes et à se combiner avec le complément, et il est facile d'échapper à la réponse immunitaire de l'organisme.